? ??規(guī)范化標(biāo)準(zhǔn)化是高質(zhì)量樣本庫的靈魂,。轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué),、精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和大數(shù)據(jù)的快速發(fā)展,,推動了臨床和基礎(chǔ)科研對大量生物樣本的需求,。隨著后基因組時代的來臨,,生物醫(yī)藥領(lǐng)域的科研人員聚焦于設(shè)計并操控生物樣本庫的采集,、處理,、分裝,、儲存,、分析,、管理、分配生物樣本和數(shù)據(jù)以備未來的研究使用,。正是基于未來研究的需求,,我院生物樣本庫在政策、法律法規(guī),、行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)化建設(shè),、運營和共享,以及生物樣本庫產(chǎn)業(yè)化和可持續(xù)性發(fā)展等諸多方面都做了許多嘗試,。
? ? 我院樣本庫成立四周年以來,,已經(jīng)與武漢大學(xué)、中科院病毒所,、華中農(nóng)業(yè)大學(xué),、湖北大學(xué)、中南醫(yī)院等科研院所以科研協(xié)作形式建立良好的科研模式,,并已參與發(fā)表高水平學(xué)術(shù)論文3篇,,另外樣本庫作為學(xué)科建設(shè)平臺參與了我院獲得的國家級重大項目(國家腫瘤重點專科建設(shè)項目、十三五國家重點研究計劃結(jié)直腸癌專病隊列研究項目以及國家重大項目城癌早診早治等)的申報并承擔(dān)了樣本采集處理存儲的工作,。值此樣本庫成立四周年之際,,樣本庫精心組織碩博士們編輯了一組樣本庫運營系統(tǒng)的解讀,使大家能更好的應(yīng)用樣本開展科研,、提升醫(yī)院科研實力,,充分發(fā)揮樣本庫在我省及我院腫瘤學(xué)科發(fā)展中的作用。
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? ??解讀一 生物樣本庫樣本采集SOP?
陳 真
????標(biāo)準(zhǔn)化操作規(guī)程是樣本庫人的共識,,也是我院樣本庫的建庫初衷,,目的是為了保證樣本中蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)、酶的功能,、代謝水平,、基因表達(dá)水平、DNA甲基化水平細(xì)胞活力水平等生物學(xué)特征的穩(wěn)定性,,滿足各類科學(xué)研究和臨床應(yīng)用的需要,。
? ? 標(biāo)準(zhǔn)化操作規(guī)程貫穿于樣本庫工作的方方面面,尤其是樣本采集環(huán)節(jié),。首先,,所有技術(shù)人員需要接受中國醫(yī)藥技術(shù)協(xié)會組織生物樣本庫分會舉辦的“全國生物樣本庫崗前培訓(xùn)”,并通過基本理論知識,、操作規(guī)程等理論考試,,獲得“生物樣本庫崗位合格證書”。其次,,參照國際,、國內(nèi)樣本庫行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范,制定符合我院院情的樣本采集SOP,。第三點,,也是最為關(guān)鍵、重要的一點,,倫理規(guī)范,,要做好“三個需要”,即需要向院倫理委員會報批樣本采集方案并通過,,需要獲得患者簽署的樣本捐贈知情同意書,,需要保護(hù)患者隱私,其中知情同意書的簽署是樣本采集的前提條件,。
? ? 每一例樣本從患者入院到存入冰箱歷經(jīng)多個步驟,,離不開各臨床科室、手術(shù)室,、病理科等各相關(guān)科室的支持和配合,。 樣本采集工作是整個樣本庫的基礎(chǔ),,標(biāo)準(zhǔn)化操作決定了樣本的品質(zhì)。
? ? 值得我們思考的是, 多樣性的研究項目對樣本的要求不盡相同,,針對一些較為特殊的樣本需求,,我們需要設(shè)計出個性化的樣本采集方案和處理方式,在樣本與研究需求間尋找到最佳平衡點,,更好的為臨床科研做好平臺服務(wù)。
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解讀二 生物樣本庫Freezer Pro?樣本管理軟件
張 林
? ? 我院生物樣本庫的樣本管理軟件Freezer Pro?是美國RuRo公司產(chǎn)品,,目前已被30多個國家近3000多個生命科學(xué)醫(yī)療機(jī)構(gòu)使用,。其中包括美國CDC、NIH,、FDA以及Roche,、BD、AMGEN等跨國企業(yè),。眾多的權(quán)威用戶證明Freezer?Pro?管理系統(tǒng)有其強大的技術(shù)優(yōu)勢,。
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? ? Freezer Pro?是一款學(xué)習(xí)型的軟件,可以根據(jù)實際工作的需要對軟件模塊進(jìn)行修改編寫,。為更好地體現(xiàn)醫(yī)院學(xué)科特色,,今年通過查找、參考大量文獻(xiàn)資料,,進(jìn)一步征求相關(guān)臨床科室和部分臨床專家意見和建議的基礎(chǔ)上,,生物樣本庫根據(jù)我院腫瘤學(xué)科亞專科分類特點,,對庫存樣本按腫瘤部位,、病種進(jìn)行全新分類,分為頭頸部腫瘤,、乳腺腫瘤,、胸體腫瘤、肝膽胰腺腫瘤,、胃腸腫瘤,、泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤、婦科腫瘤,、淋巴瘤,、腫瘤其他等9大類。共計43個樣品組,;這次的樣本管理工作不僅滿足了樣本入庫分組的需求,,同時也優(yōu)化了樣本檢索流程。同時為規(guī)范樣本信息系統(tǒng)的管理工作,,還配套推出了一系列管理制度,,完整實踐了一次PDCA,。
? ? Freezer Pro?充分實現(xiàn)了生物樣品的有序化、標(biāo)準(zhǔn)化,、高效化管理,,提高生物樣品的質(zhì)量,為科研提供信息準(zhǔn)確,、質(zhì)量可靠的生物樣品,,同時也為科研人員利用生物樣本在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診療的應(yīng)用研究中提供更為廣泛的數(shù)據(jù)收集,、整合,、分析業(yè)務(wù)流程和數(shù)據(jù)中心,為信息共享,、共研機(jī)制提供了高效協(xié)作平臺,。
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解讀三 生物樣本庫樣本使用SOP
劉媛媛
? ? 生物樣本的使用,即樣本的“出口”問題,,是一個樣本庫維持收集,、存儲、應(yīng)用的良性循環(huán),,不斷產(chǎn)出,,形成精品庫的重要一環(huán)。它需要在樣本質(zhì)量,、出庫管理,、使用反饋等各方面都嚴(yán)格把關(guān)、相互配合來共同完成,。
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? ? 首先,,我們要保證出庫的每一例樣本都是信息齊全、質(zhì)量可靠的精品樣本,。在信息方面,,它需要攜帶有大量的包括臨床診斷、個人史,、家族史,、治療史在內(nèi)的臨床信息;病理診斷、分期,、分型,、大體照片在內(nèi)的病理信息;樣本采集方法、流程及樣本特征記錄在內(nèi)的樣本信息及捐贈者知情同意書,、保密協(xié)議等的授權(quán)信息,。在質(zhì)量方面,我們遵守一系列的管理制度,、操作規(guī)范,,配備相應(yīng)的環(huán)境設(shè)施,,并對庫存樣本定期抽查質(zhì)控來保障出庫樣本的生物學(xué)特征穩(wěn)定可靠。目前,,我們庫存樣本的質(zhì)量也得到了外界的認(rèn)可和肯定,,樣本庫已參與科研協(xié)助的單位有中科院病毒所、武漢大學(xué),、華中農(nóng)業(yè)大學(xué),、湖北大學(xué)、中南醫(yī)院等,。??
? ? 生物樣本是重要的研究材料,,也是寶貴的人類遺傳資源,特別是在“基因編輯嬰兒”這類漠視學(xué)術(shù)道德倫理底線的事件出現(xiàn)后,,國家對生物樣本的采集和使用都提出了更高的倫理要求,。因此,,為提高臨床生物樣本資源使用的合理性和合法性,,我院樣本出庫執(zhí)行嚴(yán)格的申請審批流程。首先,,研究者需要如實填寫并向樣本庫遞交使用申請及研究方案的摘要,;然后,生物樣本庫,、醫(yī)院科研管理部門,、主管領(lǐng)導(dǎo)以及倫理委員會將對使用申請及研究方案進(jìn)行審批;最后,,樣本庫工作人員對批準(zhǔn)的申請單根據(jù)申請條件,,在樣本庫中進(jìn)行樣本篩選,符合要求的樣本才準(zhǔn)予出庫,。同時,,樣本的出庫遵循嚴(yán)格的管理原則:⑴審批通過的樣本申請,樣本庫方可準(zhǔn)予辦理樣本和相關(guān)資料出庫,;⑵申請者與生物樣本庫共同簽署樣本使用協(xié)議后方能執(zhí)行樣本出庫,;⑶樣本出庫信息記錄到生物樣本庫信息管理系統(tǒng);⑷在向樣本使用者提供相關(guān)資料信息時,,必須隱藏掉任何可識別捐贈者個人身份的信息,。
? ? 樣本使用后的成果反饋也很重要,它對于樣本庫評估樣本價值,、拓展樣本應(yīng)用領(lǐng)域,、改進(jìn)自身工作都有重要的意義。因此,,樣本庫工作人員還會適時追蹤樣本使用后的情況,,要求使用人及時將使用成果反饋給樣本庫,;同時,我們還積極與申請人溝通和聯(lián)系,,嘗試根據(jù)申請人需求,,調(diào)整工作程序,開展除常規(guī)收集以外的以項目為中心,,以樣本使用為導(dǎo)向的特殊樣本的收集,。充分溝通,及時反饋,,是提升樣本使用價值,、改進(jìn)樣本庫工作的有效手段,樣本庫真誠歡迎各位有需求的申請人與樣本庫多溝通,,多互動,。